一般情况下，增值税一般纳税人取得增值税专用发票，以票面注明的增值税额为进项税额，从销项税额中抵扣。

但是，有种征收率为3%的专票，可按9%或者10%的扣除率计算抵扣，不按3%票面注明的增值税额抵扣。

细心的老师已经知道了：纳税人从增值税小规模纳税人商贸企业购进的农产品取得征收率为3%的专票，可按9%或者10%的扣除率计算抵扣。

一、政策规定

纳税人购进农产品，从按照简易计税方法依照3%征收率计算缴纳增值税的小规模纳税人取得增值税专用发票的，以增值税专用发票上注明的金额和11%的扣除率计算进项税额。

自2018年5月1日起，纳税人购进农产品，原适用11%扣除率的，扣除率调整为10%。

自2019年4月1日起，纳税人购进农产品，原适用10%扣除率的，扣除率调整为9%。

政策依据：

《财政部、税务总局关于简并增值税税率有关政策的通知》（财税〔2017〕37号）

《财政部、税务总局关于调整增值税税率的通知》（财税〔2018〕32号）

《财政部、税务总局、海关总署关于深化增值税改革有关政策的公告》（财政部、税务总局、海关总署公告2019年第39号）

根据以上规定，我们可以通俗地讲：自2019年4月1日起，增值税一般纳税人购进农产品，从小规模纳税人取得征收率为3%增值税专用发票的，以增值税专用发票上注明的金额和9%的扣除率计算进项税额。

二、实务理解

请注意前述政策的几个关键词：购进农产品、3%征收率、小规模纳税人、增值税专用发票、计算进项税额。

（一）购进农产品

只有一般纳税人购进农产品，从小规模纳税人取得征收率为3%的专票，计算进项税额抵扣销项税额。

一般纳税人购进的非农产品，从小规模纳税人取得征收率为3%的税专票，以票面注明的增值税额为进项税额，从销项税额中抵扣。

（二）3%征收率

取得专票的征收率为3%，才能计算抵扣。征收率不是3%的，不能计算抵扣。

（三）增值税专用发票

小规模纳税人开具征收率为3%的增值税普通发票、电子普通发票的，不能计算进项税额。

只有从按照简易计税方法依照3%征收率计算缴纳增值税的小规模纳税人取得增值税专用发票的，以增值税专用发票上注明的金额和9%的扣除率计算进项税额。

（四）计算进项税额

以增值税专用发票上注明的金额和9%的扣除率计算进项税额。

注意计算口径：以专用发票上注明的金额。这里的“注明的金额”，不是指增值税专用发票上注明的“价税合计”金额。

举个例子。

案例01：吉祥公司为增值税一般纳税人，从商贸企业如意公司（小规模纳税人）购进农产品，取得征收率为3%的专票，票面注明金额100万，税率3%，税额3万，价税合计103万元。

计算进项税额方法01：100*9%=9万，正确。

计算进项税额方法02：103/（1+（9%）*9%=8.50万，错误。

计算进项税额方法03：103*9%=9.27万，错误。

三、案例解析

案例02：吉祥公司为增值税一般纳税人，2019年11月欲购进不含增值税额价100万的农产品，可以从张三（二道贩子）、商贸企业如意公司（小规模纳税人）和商贸企业发财公司（一般纳税人）处购进。问选择哪个供应商最划算？

大家都知道：进项税额与利润密切相关，当进项税额被抵扣时，相关的成本就下降，利润就上升。因此，进项税额的多少是关键。

我们不妨分别做个测算：

方案01：从二道贩子张三处购进

张三是增值税规定的其他个人，只能是小规模纳税人，外购农产品再转手对外销售，只能按照简易计税方法依照3%征收率计算缴纳增值税，需要开具发票的，只能向税务局申请代开。

若税务代开的是增值税普通发票，则不能抵扣。

若税务代开的是增值税专用发票，票面注明金额100万，税率3%，税额3万，价税合计103万元。则吉祥公司应计算进项税额9.00万，从销项税额中抵扣。

方案02：从商贸企业如意公司（小规模纳税人）处购进

商贸企业如意公司是小规模纳税人，外购农产品再转手对外销售，可以自行开具增值税普通发票，需要开具增值税专用发票的，目前仍需到税务机关申请代开。

但根据《国家税务总局关于增值税发票管理等有关事项的公告》（税务总局公告2019年第33号）规定，2020年2月1日起，小规模纳税人（其他个人除外）发生增值税应税行为，可以自行开具增值税专用发票。

若如意公司开具的是增值税普通发票，则不能抵扣。

若如意公司开具的是增值税专用发票，票面注明金额100万，税率3%，税额3万，价税合计103万元。则吉祥公司应计算进项税额9.00万，可从销项税额中抵扣9.00万。

因此，吉祥公司选择从商贸企业如意公司（小规模纳税人）处购进，必须取得3%的专票。

方案03：从商贸企业发财公司（一般纳税人）处购进

商贸企业发财公司是一般纳税人，2019年11月对外销售农产品，适用增值税税率9%，可开具专票。

吉祥公司取得税率为9%的专票，票面金额为100万，税率9%，税额9万，价税合计109万，进项税额为9万，可抵扣销项税额9万元。

吉祥公司选择从小规模纳税人处购进，取得3%的专票，比从一般纳税人购进并取得专票，还可多抵扣0.27万销项税额，少缴增值税附加税费。

根据以上分析，显然吉祥公司从从商贸企业如意公司（小规模纳税人）处购进农产品为最优方案，但要注意必须取得征收率为3%的专票，取得征收率为3%的专票是关键。

四、注意事项

我们已经明白：增值税一般纳税人购进农产品，选择能开具专票，按照简易计税方法依照3%征收率计算缴纳增值税的小规模纳税人为供应商最佳。

但在执行规程中，尤其是签订合同时还需注意：

1.务必约定供应商开具增值税专用发票。增值税专用发票为从商贸企业购进农产品的增值税抵扣凭证，增值税普通发票、电子普通发票不能作为增值税抵扣凭证。

2.务必约定供应商开具增值税专用发票的税率为3%的征收率。因为签订合同时是小规模纳税人，但开票时就已经升为一般纳税人。

3.选择个体工商户和商贸公司小规模纳税人做供应商，尽量不选从自然人处直接购买。

个体工商户和商贸公司小规模纳税人做供应商，是因为他们可请税务机关代开3%的专票。2020年2月1日起，小规模纳税人（其他个人除外）发生增值税应税行为，还可以自行开具增值税专用发票。

而自然人也往往不愿开票，尽管可向税务机关申请代开专票。

因此，增值税一般纳税人购进农产品，应选择个体工商户和商贸公司小规模纳税人做供应商。